Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Edc4Q3UJB9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Edc4Q3UJB9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Edc4Q3UJB9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edc4Q3UJB9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Edc4Q3UJB9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms