Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3aQ3UFY4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rsph3aQ3UFY4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms