Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Puf60Q3UEB3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Puf60Q3UEB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Puf60Q3UEB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms