Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf180Q3U827 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf180Q3U827 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf180Q3U827 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
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