Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gse1Q3U3C9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gse1Q3U3C9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gse1Q3U3C9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms