Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
XylbQ3TNA1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XylbQ3TNA1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms