Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cwc27Q3TKY6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cwc27Q3TKY6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms