Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccbe1Q3MI99 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccbe1Q3MI99 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccbe1Q3MI99 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms