Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ush2AQ2QI47 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ush2AQ2QI47 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms