Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lgQ1ERP8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lgQ1ERP8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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