Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo3bQ1EG27 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo3bQ1EG27 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo3bQ1EG27 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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