Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cers3Q1A3B0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cers3Q1A3B0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cers3Q1A3B0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cers3Q1A3B0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cers3Q1A3B0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms