Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Ttc39dQ0VF76 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc39dQ0VF76 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Ttc39dQ0VF76 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ttc39dQ0VF76 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc39dQ0VF76 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39dQ0VF76 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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