Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal1Q0VBP7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisal1Q0VBP7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms