Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ubxn2bQ0KL01 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2bQ0KL01 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn2bQ0KL01 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms