Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxc4Q08624 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc4Q08624 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms