Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn3Q07409 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn3Q07409 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms