Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4BQ07343 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4BQ07343 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms