Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox4Q06831 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox4Q06831 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms