Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cab39Q06138 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cab39Q06138 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cab39Q06138 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms