Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcad1Q04692 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcad1Q04692 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcad1Q04692 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms