Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnd1Q03719 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms