Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thbs2Q03350 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thbs2Q03350 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms