Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp11Q02853 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp11Q02853 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp11Q02853 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms