Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna1sQ02789 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna1sQ02789 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna1sQ02789 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms