Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GscQ02591 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GscQ02591 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GscQ02591 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GscQ02591 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GscQ02591 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GscQ02591 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GscQ02591 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GscQ02591 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GscQ02591 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GscQ02591 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GscQ02591 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GscQ02591 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GscQ02591 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GscQ02591 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GscQ02591 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GscQ02591 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GscQ02591 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GscQ02591 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GscQ02591 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GscQ02591 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GscQ02591 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GscQ02591 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GscQ02591 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GscQ02591 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GscQ02591 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GscQ02591 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GscQ02591 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GscQ02591 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GscQ02591 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GscQ02591 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GscQ02591 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GscQ02591 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GscQ02591 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GscQ02591 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GscQ02591 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GscQ02591 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GscQ02591 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GscQ02591 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GscQ02591 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GscQ02591 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GscQ02591 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GscQ02591 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GscQ02591 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GscQ02591 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GscQ02591 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GscQ02591 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GscQ02591 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GscQ02591 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GscQ02591 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GscQ02591 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GscQ02591 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GscQ02591 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GscQ02591 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GscQ02591 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms