Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1cQ01815 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1cQ01815 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1cQ01815 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms