Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2aQ01320 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Top2aQ01320 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2aQ01320 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms