Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Serpina1cQ00896 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpina1cQ00896 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpina1cQ00896 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpina1cQ00896 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpina1cQ00896 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpina1cQ00896 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpina1cQ00896 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serpina1cQ00896 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Serpina1cQ00896 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1cQ00896 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms