Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga4Q00651 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Itga4Q00651 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga4Q00651 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Itga4Q00651 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga4Q00651 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga4Q00651 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga4Q00651 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga4Q00651 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga4Q00651 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga4Q00651 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga4Q00651 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga4Q00651 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga4Q00651 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga4Q00651 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga4Q00651 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga4Q00651 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga4Q00651 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga4Q00651 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga4Q00651 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga4Q00651 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga4Q00651 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Itga4Q00651 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga4Q00651 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms