Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama4P97927 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama4P97927 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama4P97927 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama4P97927 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama4P97927 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama4P97927 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama4P97927 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lama4P97927 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lama4P97927 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms