Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nbr1P97432 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nbr1P97432 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nbr1P97432 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms