Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx2-3P97334 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-3P97334 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms