Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms