Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptprn2P80560 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Ptprn2P80560 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Ptprn2P80560 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprn2P80560 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Ptprn2P80560 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Ptprn2P80560 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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Ptprn2P80560 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptprn2P80560 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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