Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Msx3P70354 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msx3P70354 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msx3P70354 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msx3P70354 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msx3P70354 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Msx3P70354 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msx3P70354 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msx3P70354 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msx3P70354 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msx3P70354 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msx3P70354 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msx3P70354 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msx3P70354 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msx3P70354 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msx3P70354 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msx3P70354 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msx3P70354 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msx3P70354 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msx3P70354 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msx3P70354 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms