Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad1P70340 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad1P70340 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad1P70340 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad1P70340 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smad1P70340 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad1P70340 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad1P70340 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smad1P70340 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad1P70340 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad1P70340 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad1P70340 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad1P70340 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms