Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb13P70321 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb13P70321 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxb13P70321 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb13P70321 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms