Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgdrP70263 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtgdrP70263 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgdrP70263 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms