Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf6P70196 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf6P70196 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf6P70196 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf6P70196 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf6P70196 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf6P70196 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf6P70196 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms