Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SnrpnP63163 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SnrpnP63163 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SnrpnP63163 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SnrpnP63163 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SnrpnP63163 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SnrpnP63163 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SnrpnP63163 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SnrpnP63163 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SnrpnP63163 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SnrpnP63163 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms