Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cplx1P63040 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cplx1P63040 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cplx1P63040 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cplx1P63040 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cplx1P63040 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cplx1P63040 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cplx1P63040 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cplx1P63040 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cplx1P63040 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cplx1P63040 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cplx1P63040 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cplx1P63040 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cplx1P63040 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cplx1P63040 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms