Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps27aP62983 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps27aP62983 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms