Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmc1P62192 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmc1P62192 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms