Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch1P62046 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrch1P62046 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms