Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem258P61166 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem258P61166 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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