Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rin3P59729 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rin3P59729 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rin3P59729 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rin3P59729 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rin3P59729 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rin3P59729 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rin3P59729 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rin3P59729 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rin3P59729 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms