Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn4P59383 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn4P59383 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4P59383 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms