Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Wdhd1P59328 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdhd1P59328 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdhd1P59328 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdhd1P59328 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms