Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Csrnp3P59055 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Csrnp3P59055 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Csrnp3P59055 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Csrnp3P59055 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Csrnp3P59055 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms